我国分离的甲病毒YN87448毒株全部结构区基因核苷酸的序列测定及分析

被引：15

作者：

周国林

梁国栋

李蕾

付士红

李福胜

金奇

张海林

黄文丽

侯云德

机构：

[1] 中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程国家重点试验室!北京,中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程国家重点试验室!北京,中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程国家重点试验室!北京,中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程国家

来源：

病毒学报 | 1999年 / 03期

关键词：

辛德毕斯样病毒; 克隆; 逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR); 核苷酸序列;

D O I：

10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001169

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

ＹＮ８７４４８毒株１９８６年分离自云南傣族５２岁女发热病人的血液标本，曾用血清学方法鉴定为披膜病毒科甲病毒属。用我们创立的单引物差异ＲＴ－ＰＣＲ方法及简并引物ＲＴ－ＰＣＲ法均已证明：该病毒为甲病毒属的辛德毕斯样病毒（Ｓｉｎｄｂｉｓ－ｌｉｋｅｖｉｒｕｓ）。本研究从甲病毒属的病毒基因序列的共同保守区，设计４对引物。用ＲＴ－ＰＣＲ方法扩增，再将扩增片段分别连结克隆到ｐＧＥＭ－Ｔ载体。通过对４个克隆的测序完成了对ＹＮ８７４４８毒株的全部结构区基因序列的测定，结果表明：（１）ＹＮ８７４４８病毒的全部结构区基因序列长度为４０５９个核苷酸（不包括多聚腺苷酸尾）；（２）ＹＮ８７４４８病毒的全部结构区基因与辛德毕斯病毒家族中毒力最强的、唯一能致成年小鼠１００％死亡的、南非分离的辛德毕斯样病毒Ｓ Ａ ＡＲ８６株相应基因的核苷酸序列同源性为９９％，但ＹＮ８７４４８毒株不致成年小鼠死亡；（３）二者基因结构上有一点大的差异是，ＹＮ８７４４８病毒位于基因组８６４１ｂｐ处的结构区基因Ｅ２和Ｅ３之间多出３个核苷酸（ＡＡＡ）；（４）与其它甲属病毒的进化树比较来看

引用

页码：205 / 211

页数：7

共 4 条

[1] 我国分离的甲病毒YN87448株基因组序列的初步分析 [J].