越橘VcANS基因的克隆及表达分析

被引:10
作者
李晓艳 [1 ]
裴嘉博 [1 ]
张志东 [1 ]
吴林 [1 ]
刘海广 [1 ]
李海燕 [2 ]
李亚东 [1 ]
机构
[1] 吉林农业大学园艺学院
[2] 教育部生物反应器与药物开发工程研究中心
关键词
越橘; 花色素合成酶; RACE; 序列分析; 基因表达;
D O I
10.13207/j.cnki.jnwafu.2012.06.025
中图分类号
S663.9 [其他];
学科分类号
090201 ;
摘要
【目的】从越橘果实中克隆花色素合成酶(ANS)基因cDNA,为研究越橘花色素苷合成的分子机制奠定基础。【方法】以越橘(Vacciniumspp.)品种"北陆"(V.corymbosum L.)为试材,并以Illumina测序文库(NCBI登录号:SRA046311)中差异表达的Unigene 38125片段为基础,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得花色素合成酶基因全长cDNA,利用DNAMAN和MEGA软件进行多序列比对和系统进化分析,探讨ANS基因在不同组织和器官中的相对表达量及其与对应花色素苷含量的关系。【结果】成功克隆了越橘花色素合成酶基因序列,命名为VcANS,GenBank登录号为JN654701。序列分析结果表明,VcANS全长1 424bp,包含93bp的5′非编码区、248bp的3′非编码区和1个长度为1 083bp编码360个氨基酸的开放阅读框,该基因编码的蛋白具有ANS家族普遍存在的2-酮戊二酸和Fe2+-依赖的氧化酶超家族的保守结构域。序列比对和系统进化分析表明,VcANS与杜鹃花科植物亲缘关系最近。在越橘果实发育的不同阶段,VcANS相对表达量的变化与花色素苷含量的变化趋势具有一致性。【结论】获得了越橘花色素合成酶基因全长,推测其对越橘花色素苷的形成起调控作用。
引用
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页数:9
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