基于级联神经网络的蛋白质二级结构预测

被引：7

作者：

王艳春 ^{[1
,2
]}

何东健 ^{[3
]}

王守志 ^{[4
]}

机构：

[1] 西北农林科技大学机械与电子工程学院

[2] 青岛农业大学信息科学与工程学院

[3] 西北农林科技大学信息工程学院

[4] 威海职业学院机电工程系

来源：

计算机工程 | 2010年 / 36卷 / 04期

关键词：

神经网络; 蛋白质; 二级结构预测;

D O I：

暂无

中图分类号：

TP183 [人工神经网络与计算];

学科分类号：

081104 ; 0812 ; 0835 ; 1405 ;

摘要：

为提高蛋白质二级结构预测的精度,提出一种由两层网络构成的级联神经网络模型。第1层网络采用具有差异度的5个子网构成的网络模型,对第2层网络的输入编码进行改进。对PDBSelect25中的36条蛋白质共6122个残基进行测试,结果表明,该模型能有效预测蛋白质二级结构,其预测精度分别比SNN,DSC,PREDSATOR方法提高5.31%,1.21%和0.92%,平均预测精度提高到69.61%。

引用

页码：22 / 24

页数：3

共 6 条

[1]

Multilayer feedforward networks are universal approximators. Hornik K, Stinchcombe M, White H. Neural Networks . 1989

[2]

Pre-diction of protein secondary structure using improved two-level neuralnetwork architecture. HUANG Xin,HUANG De-shuang,ZHANG Guang-zheng,et al. Protein&Peptide Letter . 2005

[3]

Prediction of protein sec-ondary structure by multi-modal neural networks. Zhu Hanxi,Yoshihara I,Yamamori K. Proc of International Joint Conference on Neural Networks . 2002

[4]

Protein secondary structure prediction with a neural network. Holley L H, Karplus M. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 1989

[5]

Predicting the secondary structure of globular proteins using neural network models. Qian N, Sejnowski TJ. Journal of Molecular Biology . 1988

[6]

Dictionary of protein secondary structure: pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features. Kabsch W, Sander C. Biopolymers . 1983

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