熊猫等动物犬瘟热病毒附着蛋白基因的遗传多样性

被引:15
作者
何洪彬
李金中
夏咸柱
余春
范泉水
黄耕
邱薇
殷震
机构
[1] 东北农业大学生命科学院!黑龙江哈尔滨,解放军农牧大学兽医研究所!吉林长春,解放军农牧大学兽医研究所!吉林长春,解放军农牧大学兽医研究所!吉林长春,成都军区联勤部军事医学研究所!云南昆明,解放军农牧大学兽医研究所!吉林长春,成都军区
关键词
犬瘟热病毒; 附着蛋白基因; 遗传多样性;
D O I
10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001249
中图分类号
S852.65+9.5 [负股单股RNA病毒]; Q52 [核酸];
学科分类号
摘要
为了研究犬瘟热病毒 (caninedistempervirus,CDV)大熊猫株、小熊猫株和长春犬株附着蛋白 (H)基因的遗传变异 ,对H基因进行了序列测定。上述 3个CDV毒株的H基因全长均为 1946bp ,开放阅读框架 (ORF)始于 2 1~2 3位的ATG ,终止于 1842~ 1844位的TGA ,编码 6 0 7个氨基酸。与GenBank中 15个CDV株推导的H蛋白氨基酸序列比较发现 ,16个野毒株潜在的N -联糖基化位点为 8或 9个 ,而疫苗株Onderstepoort和Convac分别为 4个和 7个 ,其中 30 9~ 311位氨基酸所形成的潜在的糖基化位点是疫苗株没有而野毒株共有的 ,N -联糖基化位点的不同可能影响H蛋白的抗原性。用DNASIS软件分析H基因的系统发生 ,其中野毒株组成一组 ,该组又分成 5个谱系 ,分别为GP、LP、MINK ,2 5 44、40 4、45 13、DANDOG ,A92 - 6、LEOP、JAVE、RACC、AMEDOG ,HAMA、UENO ,GREEN、LIU谱系 ;而疫苗株与野毒株H基因之间存在明显的差异 ,组成了另一组 ,上述结果表明CDVH蛋白基因存在基因型的差别 ,具有广泛的遗传多样性。
引用
收藏
页码:238 / 241
页数:4
相关论文
共 6 条
[1]  
Single-step method of RNA isolation by Acid Guanidinium Thiocyanate-phenol-chloroform. Chomczynski P,Sacchi N. Extraction Analytical Biochemistry . 1987
[2]  
Genetic diversity of the attachment (H) protein gene of current field isolates of canine distemper virus. Bolt G,Jensen T D,Gottschalck E,et al. Journal of General Virology . 1997
[3]  
Vaccine induced canine distemper in a lesser panda. Bush M,Montali R J,Brownstein D,et al. Journal of the American Veterinary Medical Association . 1976
[4]  
Studies on manifestations of canine distemper virus infection in an urban dog population. Blixenkrone-Mφller M,Svansson V,Have P,et al. Veterinary Microbiology . 1993
[5]  
Molecular and phylogenetic analyses of the haemagglutinin (H) proteins of field isolates of canine distemper virus from naturally infected dog. Iwatsuki K,Miyashita N,Yoshida E,et al. Journal of General Virology . 1997
[6]  
Canine distemper virusfrom diseased large felids,biological properties and phylogeneticrelationship. Harder T C,Kenter M,Vos H,et al. Journal of General Virology . 1996