荧光PCR-16SrDNA测序法鉴定金黄色葡萄球菌的FTA卡制备DNA模板条件的优化

被引:1
作者
陈霖祥 [1 ,2 ]
蔡颖 [2 ]
周广彪 [2 ]
林昆 [1 ]
机构
[1] 汕头大学医学院公共卫生与预防医学教研室
[2] 汕头出入境检验检疫局检验检疫技术中心
关键词
FTA卡; 细菌鉴定; DNA测序; 荧光PCR; 优化;
D O I
暂无
中图分类号
R372 [病原微生物分类与鉴定];
学科分类号
摘要
目的:优化荧光PCR-16S rDNA测序法鉴定金黄色葡萄球菌的FTA卡DNA模板制备的条件。方法:以金黄色葡萄球菌菌株为样品,将不同浓度菌液滴在FTA卡上,并用打孔器打出不同直径卡片,分别进行荧光PCR-16S rDNA测序,根据荧光PCR的Cp值和测序结果优化最合适的FTA卡制备DNA模板条件。结果:采用直接扩增法进行SYBR Green荧光PCR反应时,在直径为0.5、1.0和2.0 mm的卡片中,只有0.5 mm的卡片获得扩增产物。6.0×104~7cfu/mL菌液制备的FTA样品卡,SYBR Green荧光PCR扩增的Cp值在14.8~28.2范围内,其测序产物数据较为理想。结论:6.0×104~7cfu/mL菌液制成的FTA样品卡,打出直径为0.5 mm卡片,适于荧光PCR-16S rRNA测序法鉴定金黄色葡萄球菌。
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