桑萜类生物合成酶HMGR的生物信息学分析

被引：8

作者：

雷桅

汤绍虎

周启贵

税晓容

孙一铭

孙敏

机构：

[1] 西南大学生命科学学院三峡库区生态环境教育部重点实验室

来源：

蚕业科学 | 2008年 / 03期

关键词：

桑; 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶; 生物信息学; 萜类化合物;

D O I：

10.13441/j.cnki.cykx.2008.03.005

中图分类号：

S888.2 [桑树生理、生态、生物物理、生物化学];

学科分类号：

090504 ;

摘要：

萜类化合物是桑叶具有药用功效的主要化学成分之一。利用Vector NTI Suit 8等工具,对GenBank中的桑萜类生物合成关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因的核苷酸和氨基酸序列进行了生物信息学分析。桑hmgr基因序列以基因组DNA形式登录,其中1-5 905 bp区间为该基因序列,包括启动子、CDS和内含子序列,推测其编码蛋白的分子式为C2602H4181N715O786S29,亚细胞定位于线粒体,存在跨膜结构域,且含有22个氨基酸的质体转运肽,是含有HMG-CoA-reductase-classⅠ重要功能域的疏水性蛋白,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构中含有2个HMG-CoA和2个NADP(H)结合位点。

引用

页码：393 / 399

页数：7

共 9 条

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