基于rDNA ITS序列研究蚌科6种类的系统发生关系

被引：4

作者：

许志强 ^{[1
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葛家春 ^{[1
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李晓晖 ^{[2
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霍光明 ^{[3
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潘建林 ^{[1
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机构：

[1] 江苏省淡水水产研究所

[2] 南京师范大学生命科学学院

[3] 南京晓庄学院生命科学系

来源：

淡水渔业 | 2009年 / 39卷 / 01期

关键词：

蚌科; 核糖体转录间隔区; 系统发生;

D O I：

暂无

中图分类号：

S966.22 [蚌的养殖];

学科分类号：

090801 ;

摘要：

通过测定核糖体转录间隔区ITS1以及ITS2序列研究了江苏地区蚌科(Unionidae)6种常见贝类——褶纹冠蚌(Cristaria plicata)、三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)、背角无齿蚌(Anodneta woodiana woodiana)、扭蚌(Arconaialanceolata)、圆顶珠蚌(Unio douglasiae)以及背瘤丽蚌(Lamprotula leai)的系统发生关系。结果显示:6种蚌的ITS1序列长度介于354～439 bp之间,平均G+C百分含量为52.7%;ITS2序列长度介于287～354 bp之间,平均G+C百分含量为51.2%。对6种贝类的相关序列进行比对,ITS1的比对长度包括501个位点,其中有364个变异位点和99个简约信息位点;ITS2的比对长度包括381个位点,其中有259个变异位点和66个简约信息位点。以虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)为外群,采用邻接法(NJ)分析6种贝类的系统发生关系,贝类明显聚合为3个类群:类群Ⅰ包括三角帆蚌(H.culingii)和背瘤丽蚌(L.leai),类群Ⅱ包括扭蚌(A.lanceolata)和圆顶珠蚌(U.douglasiae),类群Ⅲ由背角无齿蚌(A.woodiana woodiana)和褶纹冠蚌(C.plicata)组成。

引用

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共 12 条

[1] Exploring the phylogenetic utility of ITS sequences for animals:: A test case for abalone (Haliotis) [J].