水稻分蘖相关性状的QTL定位与分析

被引:5
作者
梁永书
张启军
叶少平
刘明伟
殷得所
李平
机构
[1] 四川农业大学水稻研究所
关键词
水稻测序品种; 分蘖; SSR连锁图谱; QTL分析; 生物信息学分析;
D O I
暂无
中图分类号
S511 [稻];
学科分类号
0901 ;
摘要
应用147个SSR标记,对水稻测序品种日本晴(Nipponbare以下简称Nipp)×广陆矮4号(部分 测序,以下简称GLA)的F2群体进行基因检测,构建了全长为1736.6cM、覆盖水稻基因组12条染色体 的连锁图,采用QTLCart1.7统计软件对水稻分蘖相关性状如分蘖数、穗数、有效分蘖数、分蘖率等4 个性状的基因座位进行定位分析,检测到5个主效果基因和17个微效基因,同时结合基因组研究的 最新成果,对7个与标记间遗传距离为0(QTL POS=0)的OTLs进行生物信息学的分析,尝试用OTL 定位预测基因的功能。
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THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 1997, 95 (04) :553-567
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[7]   MOLECULAR MAPPING OF RICE CHROMOSOMES [J].
MCCOUCH, SR ;
KOCHERT, G ;
YU, ZH ;
WANG, ZY ;
KHUSH, GS ;
COFFMAN, WR ;
TANKSLEY, SD .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 1988, 76 (06) :815-829