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- [1] Complete genome analysis of enterovirus 71 isolated from an outbreak in Taiwan and rapid identification of enterovirus 71 and coxackievirus A16 by RT-PCR .2 Yan J,Su I,Chen P,et al. J Med Virol . 2001
柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析
被引：62
作者：
李琳琳
何雅晴
朱俊萍
薛颖
朱雅芳
徐星晔
金奇
机构：
[1] 中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室
来源：
关键词：
柯萨奇病毒;
基因组;
手足口病;
同源性分析;
D O I：
10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001538
中图分类号：
R373.23 [];
学科分类号：
摘要：
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。
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