模糊聚类分析方法在DNA序列分类中的应用

被引:8
作者
顾俊华
盛春楠
韩正忠
机构
[1] 东南大学软件学院
[2] 东南大学软件学院 江苏南京
[3] 江苏南京
关键词
模糊聚类分析法; 相关系数法; 序列; 碱基密度;
D O I
暂无
中图分类号
Q78 [基因工程(遗传工程)];
学科分类号
071007 ; 0836 ; 090102 ;
摘要
该文采用模糊聚类分析的方法对DNA序列进行分类。首先从DNA序列中单个碱基分布的“密度”角度出发,提取出DNA序列的特征,然后用模糊聚类分析中常用的方法对DNA序列进行分类。该文运用自行研制开发的集成11种模糊聚类分析算法的模糊聚类分析运算工具,首先对已知的1-20个DNA序列进行模糊聚类分析,根据分类结果的精度,找出了较优的6种聚类分析算法,然后用余下的21-40个DNA序列进行分类;最后,本文一次对所有的1-40个DNA序列进行归类,并综合了所有的分类结果,将难以归类的DNA序列进行了归类。分析结果表明,模糊聚类分析算法具有分类简单且分类结果精度较高的优点。
引用
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页码:115 / 118+136
页数:5
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共 2 条
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徐晓秋 ;
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