有机质谱学在中药药效物质的结构确定中起到了至关重要的作用.对中药药效物质质谱的确切解释需要对这些药效物质质谱的关键裂解规律有足够的了解.应用有机质谱学规律对中药药效物质的结构确定进行了讨论.这些中药的药效物质包括:应用超临界二氧化碳从蛇床子中提取的蛇床子素和从厚朴中提取的厚朴酚与和厚朴酚;应用水蒸汽蒸馏从鱼腥草中提取的鱼腥草素等.具有较高丰度的质谱关键碎片峰m/z229的出现是蛇床子素质谱的典型特征;质谱关键碎片峰m/z169的出现是鱼腥草素质谱的典型特征.而质谱关键碎片峰m/z247是否出现则是区分厚朴酚与和厚朴酚的质谱典型特征.在此基础上,尝试构建中药药效物质的有机质谱学平台.