中国东海海洋微生物种群多样性初步研究

被引:25
作者
宋志刚 [1 ]
许强芝 [2 ]
鲁心安 [1 ]
焦炳华 [2 ]
艾峰 [2 ]
杨妤 [2 ]
刘小宇 [2 ]
施晓琼 [2 ]
机构
[1] 华东师范大学生命科学学院
[2] 第二军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室
关键词
海洋微生物; 种群多样性; ARDRA; ERIC-PCR;
D O I
10.13344/j.microbiol.china.2006.01.015
中图分类号
Q938.8 [水生微生物学];
学科分类号
摘要
以东海海洋微生物群落为研究对象,用稀释平板分离法,从海泥和海水中得到542株分离物。随机选取58株发酵培养,将所有发酵菌株的16S rDNA基因扩增,并用限制性内切酶HinfI对PCR产物进行ARDRA(Amplified rDNA restriction analysis)多态性分析,共得到16种不同的操作分类单元(Operational Taxonom ic Un it,OTU)。其中OTU5和OTU7所包含的菌株分别占总分离物的32.7%和19.0%,为优势分离物。优势分离物的ER IC-PCR基因组指纹图分析表明,前者的19株分离物共有12种不同的指纹图类型,而后者的11株分离物有4种。结果显示,东海海域的海水和底泥具有明显的微生物种群多样性特征。
引用
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共 2 条
[1]  
ERIC-PCR:一种快速鉴别环境细菌菌株的方法[J]. 赵立平,肖虹,李艳琴,张峰.应用与环境生物学报. 1999(S1)
[2]  
海洋生物技术原理和应用[M]. 海洋出版社 , 张士璀等 主编, 1997