目的利用分子生物学检测技术,对2012年5月以来发生在广东省粤西地区罗定市的一起病毒性脑炎疫情进行快速的病原体检测和分子型别的鉴定。方法利用人肠道病毒通用荧光定量RT-PCR对病例的32份脑脊液(CSF)标本和7份粪便标本进行人肠道病毒的核酸快速筛查,再利用半巢式聚合酶链反应(Sn-PCR)对人肠道病毒阳性标本的部分VP1区进行扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,使用分子定型方法对人肠道病毒进行型别鉴定。结果人肠道病毒通用荧光定量RT-PCR筛查结果显示32份CSF标本中有26份阳性,7份粪便标本全部阳性;阳性率分别为81.3%和100.0%。对33份阳性标本进行Sn-PCR扩增,22份显示有目的条带,测序结果显示15份CSF标本中13份为埃可病毒(ECV)30、2份为ECV9;7份粪便标本中6份为ECV30、1份为ECV9。结论发生在2012年广东省粤西地区罗定市的一起病毒性脑炎疫情是由以ECV30为主的人肠道病毒引起的;荧光定量RT-PCR法与Sn-PCR法结合核苷酸序列测定和分析可以对人肠道病毒脑炎进行快速检测和病原型别鉴定。