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2009年新型甲型H1N1流感病毒非结构蛋白基因进化分析
被引:5
作者:
李淑华
韩一芳
苏彤
鹿文英
曹广文
机构:
[1] 第二军医大学基础部流行病学教研室
来源:
基金:
上海市自然科学基金;
关键词:
H1N1甲型流感病毒;
非结构蛋白;
进化;
变异;
D O I:
暂无
中图分类号:
R373 [人体病毒学(致病病毒)];
学科分类号:
100103 ;
100705 ;
摘要:
目的:探讨2009年新型甲型H1N1流感病毒的非结构蛋白(NS)基因进化规律。方法:从NCBI下载2009年新型甲型H1N1流感病毒以及北美、欧洲、亚洲地区以往流行的甲型H1N1流感病毒NS基因序列,利用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0(MEGA4.0)软件对所选序列进行基因进化分析,并用NJ法构建进化树;对2009年新型甲型H1N1流感病毒NS基因核苷酸序列同源性及编码蛋白氨基酸序列进行分析。结果:2009年新型甲型H1N1流感病毒NS基因来源于猪A/H1N1流感病毒,与2005~2007年猪A/H1N1流感病毒具有较高的同源性(97.5%~97.6%),与1930~2007年猪A/H1N1流感病毒具有明显的时间进化关系;其重要抗原及拮抗宿主抗病毒能力的氨基酸位点基本没有变异。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒NS基因来源于猪A/H1N1流感病毒,NS基因编码蛋白拮抗宿主抗病毒能力并没有改变。
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