出血性大肠杆菌O157:H7的脉冲场凝胶电泳分型方法研究

被引:7
作者
黄彦
孙贵娟
唐振柱
李秀桂
王红
吕素玲
蒋震羚
车光
黄兆勇
方志峰
机构
[1] 广西壮族自治区疾病预防控制中心
关键词
出血性大肠杆菌O157:H7; 脉冲场凝胶电泳; 聚类分析;
D O I
暂无
中图分类号
R378 [病原细菌];
学科分类号
100103 ; 100705 ;
摘要
目的应用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)对肠出血性大肠杆菌O157:H7进行基因分型,了解不同来源分离株的相关性。方法选择在广西食品污染物检测地区食品样本中分离到的7株出血性大肠杆菌O157:H7,采用琼脂糖包埋胶块法制备基因组DNA,以XbaⅠ限制性内切酶进行酶切,选定脉冲电泳参数进行脉冲场凝胶电泳,照相记录结果;Nei的公式计算相似性和遗传距离,并用PHYLIP程序非加权成对算术平均法聚类分析。结果PFGE可生成14~18条清晰条带的分离株DNA指纹图谱,由聚类分析树状图可将7株分离株分为6个基因群。结论广西不同地区食品分离O157:H7血清型菌株存在多个分子亚型,提示不是一个克隆株,研究发现脉冲场凝胶电泳分型技术重复性高,在分子流行病学研究中有较大的应用前景。
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疾病监测, 2005, (09) :16-18