杭州地区2010~2011年急性腹泻患儿病原诺如病毒基因型及分子特征研究

被引:1
作者
金赛燕 [1 ]
林洁 [2 ]
徐秀娟 [3 ]
钟德明 [3 ]
机构
[1] 杭州市肿瘤医院检验科
[2] 杭州市上城区中医院检验科
[3] 杭州市西湖区西溪街道社区卫生服务中心
关键词
诺如病毒; 基因型别; 分子特征; 腹泻; 儿童;
D O I
10.13602/j.cnki.jcls.2012.11.028
中图分类号
R725.7 [小儿消化系及腹部疾病];
学科分类号
100201 [内科学];
摘要
目的探讨杭州地区2010~2011年婴幼儿急性腹泻病原诺如病毒(NV)基因型及其分子特征。方法用多重RT-PCR方法对325份5岁以下急性腹泻患儿粪便标本进行NV检测,选择阳性扩增片段进行基因测序,并对序列进行系统进化分析。结果杭州地区急性腹泻患儿感染NV的阳性率为13.85%(45/325),NV GⅠ型7株,GⅡ型38株;序列结果分析显示3株NV GⅠ型与AB522407.1、EU085525.1、EU085523.1和FJ383829.1的同源性达93.2%~100%,进化树显示其亲缘关系较近;进化树显示12株属于GⅡ-4型,且与GQ845367.2、AB291542.2、JQ934814.1和JQ613509.1的同源性高达94.7%~100%;4株GⅡ-3型与JF896130.1和EU400377.1同源性高达97.9%~100%;1株GⅡ-4型与GQ380647.1的同源性仅为93.6%。结论 NV是2010~2011年导致杭州地区儿童急性腹泻的重要病原之一,以NV GⅡ-4型为主,可能是流行优势株。
引用
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Tan, Ming ;
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Duan, Zhao-Jun .
INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, 2011, 11 (07) :1716-1726
[3]
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Mans, Janet ;
de Villiers, J. Corrie ;
du Plessis, Nicolette M. ;
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Taylor, Maureen B. .
JOURNAL OF CLINICAL VIROLOGY, 2010, 49 (04) :258-264
[4]
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