重复序列ERIC(IRU)研究进展

被引：19

作者：

林朝洪 ^{[1
]}

倪学勤 ^{[1
]}

曾东 ^{[1
]}

周小秋 ^{[2
]}

机构：

[1] 四川农业大学动物科技学院

[2] 四川农业大学动物营养研究所

来源：

微生物学报 | 2007年 / 02期

关键词：

重复序列; ERIC(IRU); ERIC-PCR; 动物肠道菌群;

D O I：

10.13343/j.cnki.wsxb.2007.02.037

中图分类号：

Q75 [分子遗传学];

学科分类号：

071007 ;

摘要：

重复序列几乎存在于所有生物的基因组中。"肠道细菌基因间重复序列"(Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus,ERIC)是主要存在于肠道细菌的一类基因间重复序列,也称为"基因间重复单位"(Intergenic Repetitive Unit,IRU)。ERIC(IRU)首先在大肠杆菌(Escherichia coli)中发现,后来又在多种其他细菌中发现。ERIC(IRU)长127bp,有的还有插入序列。绝大多数ERIC(IRU)都可以转录,mRNA形成茎环结构。ERIC(IRU)局限于基因组可转录区,即多顺反子操纵子基因间区域,或开放阅读框架上、下游非翻译区。ERIC(IRU)很可能调节侧翼基因(flanking gene)的表达。ERIC(IRU)高度保守,可能其变异受到自然选择压力的限制或它本身就可能是"自私的DNA"(selfish DNA)。Versalovic等建立起ERIC-PCR,它可以有效地同时平行分析不同生态系统的结构差异以及动态监测同一生态系统微生物群落结构的变化。近年来这一技术逐渐运用到对动物肠道菌群的研究上。

引用

页码：370 / 373

页数：4

共 12 条

[1] 中国东海海洋微生物种群多样性初步研究 [J].