基于核糖体DNA大亚基片断序列探讨中国东海海域赤潮原甲藻的分子分类

被引:29
作者
王鹏
梁君荣
高亚辉
高杨
吕颂辉
齐雨藻
李雪松
俞志明
机构
[1] 厦门大学生命科学学院,厦门大学生命科学学院,厦门大学生命科学学院,厦门大学生命科学学院,暨南大学水生生态研究所,暨南大学水生生态研究所,厦门大学生命科学学院,中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室福建厦门,福建厦门,福建厦门,福建厦门,广东广州,广东广州,福建厦门,山东青岛
关键词
具齿原甲藻; 东海赤潮原甲藻; LSUrDNA; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
Q949.24 [甲藻门];
学科分类号
071001 [植物学];
摘要
采用PCR扩增技术对分类上有争议的中国东海赤潮原因种(被称为东海原甲藻,本文简称:东海株系)的基因组DNA进行了核糖体DNA大亚基片断(LSUrDNA)的扩增和测序,并与一同扩增的来自美国CCMP的被称为具齿原甲藻(本文简称:CCMP株系)的同源序列进行分析比较.结果表明,两者710bp的LSUrDNA同源序列中仅存在7个碱基的差异,遗传相似度高达99. 01%,遗传差异为0. 99%.进一步与Genebank其他3种原甲藻即P.mexicanum、P.micans和P.minimum的同源序列进行比较,发现其他3种原甲藻两两间的种间遗传相似度在91. 1% 95. 5%之间,而P.micans和P.minimum种内不同株系的遗传相似度为99. 4% 99. 9%,均为99%以上.综合这些数据说明东海株系与CCMP株系之间的0. 99%的遗传差异应视为种内差异,原甲藻的东海株系与CCMP株系当属异名同种.因此本试验结果从分子水平支持了被称为东海原甲藻的原甲藻与被称为具齿原甲藻(P.dentatum)的原甲藻同为一种的观点.
引用
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