DNA序列在植物系统学研究中的应用

被引：102

作者：

田欣

李德铢

机构：

[1] 中国科学院昆明植物研究所,中国科学院昆明植物研究所云南昆明,云南昆明

来源：

云南植物研究 | 2002年 / 02期

关键词：

DNA序列; 进化速率; 系统学意义;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q949 [植物分类学（系统植物学）];

学科分类号：

071001 ;

摘要：

植物DNA序列由于进化速率上的差异而适用于不同分类阶元的系统发育研究 ,因此 ,针对某一特定的系统学问题选择相应合适的分子片段是分子系统学研究中最为关键的一步。在前人研究的基础上 ,主要讨论了目前分子系统发育和进化研究中一些常用的DNA序列的适用范围 ,包括nrDNA的 18S基因及ITS等非编码区 ,cpDNA的编码基因 (rbcL、matK、ndhF、atpB)及非编码区序列 (rpL16、rpoC1、rps16、trnL F和trnT L)和应用较少的mtD NA。研究表明 ,18S、rbcL等编码基因及mtDNA一般适用于较高分类阶元甚至整个种子植物谱系间的系统发育的探讨 ,而ITS及cpDNA的非编码区序列等因其较快的进化速率多用于较低分类阶元的系统关系研究。

引用

页码：170 / 184

页数：15

共 14 条

[1]

A Comparison of ITS Nuclear rDNA Sequence Data and AFLP Markers for Phylogenetic Studies in Phyllostachys （Bambusoideae, Poaceae）[J] . Trevor R Hodkinson,Stephen A Renvoize,Graínne Ní Chonghaile,Christopher MA Stapleton,Mark W Chase.Journal of Plant Research . 2000 (3)

[2] Chloroplastrps16 intron phylogeny of the tribeSileneae (Caryophyllaceae) [J].

Bengt Oxelman ;

Magnus Lidén ;

Daniel Berglund .

Plant Systematics and Evolution, 1997, 206 :393-410

[3] The alcohol dehydrogenase genes of cotton [J].

Millar, AA ;

Dennis, ES .

PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 1996, 31 (04) :897-904

[4]

The allopolyploid origin of kiwifruit, Actinidia deliciosa （ Actinidiaceae ）[J] . Ross G. Atkinson,Guido Cipriani,David J. Whittaker,Richard C. Gardner.Plant Systematics and Evolution . 1997 (1)

[5]

Comparison of the evolution of ribulose-1, 5-biphosphate carboxylase （rbcL） and atpB-rbcL noncoding spacer sequences in a recent plant group, the tribe Rubieae （Rubiaceae）[J] . Jean-Fran?ois Manen,Alessandro Natali.Journal of Molecular Evolution . 1995 (6)

[6] HIGH-RATES OF NUCLEOTIDE SUBSTITUTION IN NUCLEAR SMALL-SUBUNIT (18S) RDNA FROM HOLOPARASITIC FLOWERING PLANTS [J].

NICKRENT, DL ;

STARR, EM .

JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION, 1994, 39 (01) :62-70

[7]

Phylogeny of Rubiaceae-Rubieae inferred from the sequence of a cpDNA intergene region[J] . Plant Systematics and Evolution . 1994 (3)

[8]

Ninety extra nucleotide in ndhF gene of tobacco chloroplast DNA: a summary of revisions to the 1986 genome sequence[J] . Richard G. Olmstead,Jennifer A. Sweere,Kenneth H. Wolfe.Plant Molecular Biology . 1993 (6)

[9]

Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA[J] . Pierre Taberlet,Ludovic Gielly,Guy Pautou,Jean Bouvet.Plant Molecular Biology . 1991 (5)

[10] PHYLOGENETIC-RELATIONSHIPS OF THE SANTALALES AND RELATIVES [J].

NICKRENT, DL ;

FRANCHINA, CR .

JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION, 1990, 31 (04) :294-301

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