苎麻Actin1基因克隆及其在韧皮部纤维不同发育阶段的表达

被引:25
作者
马雄风 [1 ,2 ]
喻春明 [1 ]
唐守伟 [1 ]
朱爱国 [1 ]
王延周 [1 ]
朱四元 [1 ]
刘建新 [1 ]
熊和平 [1 ]
机构
[1] 中国农业科学院麻类研究所/农业部麻类遗传改良与工程微生物重点开放实验室
[2] 中国农业科学院棉花研究所
关键词
苎麻; 肌动蛋白; 基因克隆; 实时定量PCR;
D O I
暂无
中图分类号
S563.1 [苎麻];
学科分类号
090104 [作物信息科学与技术];
摘要
通过cDNA文库的PCR筛选法获得苎麻内源肌动蛋白基因片段,采用苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud]中苎1号为材料,结合RACE技术获得了苎麻的Actin1蛋白编码基因(BnACTIN1)的cDNA全长序列(GenBank登录号为DQ665832,2009年8月1日公布),该基因全长cDNA序列1782bp,编码区长1134bp,编码377个氨基酸残基。Blastn分析表明,BnACTIN1基因与桑树(Morusalba:DQ785808)、蓖麻子(Ricinus communis:AY360221)、棉花(Gossypium hirsutum:AY305723-305736)等植物的肌动蛋白基因序列有高度的同源性。对推导的氨基酸序列进行分子进化分析表明,该基因与棉花Actin蛋白家族AAP73451.1、AAP73457.1聚为一类,三者之间的亲源关系最近。建立荧光定量PCR体系,用18SrRNA和Histone3内参基因对表达水平均一化,分析BnACTIN1基因在苎麻纤维细胞伸长过程中的表达水平变化。结果表明,在株高97cm时最高,约为株高11、150和220cm时表达量的230倍以上,是株高47cm时期的20倍。本研究揭示的所获得BnACTIN1序列为苎麻的Actin1蛋白编码基因,其最高表达时期开始于纤维快速伸长时期,但稍早于纤维发育的高峰期,推测该基因可能与韧皮部纤维伸长过程中的肌细胞骨架形成有关。
引用
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