肠道病毒71型中国分离株全基因组核苷酸序列分析

被引:34
作者
杨帆
金奇
何雅青
李良成
侯云德
机构
[1] 病毒基因工程国家重点实验室!北京
关键词
肠道病毒71型; 核苷酸序列分析; 同源性分析;
D O I
暂无
中图分类号
R373 [人体病毒学(致病病毒)];
学科分类号
摘要
全基因组的5个首尾重叠的克隆,并在此基础上进行了全基因组(未包括多聚腺苷酸尾)7408个碱基的核苷酸序列测定.数据分析表明,SHZH98株与其他EV71毒株相比,5’UTR和3’UTR的长度和序列有一定的差异.同源性分析发现,与免疫源性密切相关的P1结构蛋白基因与台湾流行株的同源性最高,与欧美流行株的同源性较低,P2,P3区非结构蛋白基因的同源性与Coxsakievirus A16及MS,BrCr株较高,而与台湾流行株相比则较低.遗传进化分析发现,SHZH98株结构蛋白基因与台湾流行株亲缘关系较近,而非结构蛋白基因与Coxsakievirus A16及MS,BrCr株的亲缘关系较近.上述结果在分子水平上对肠道病毒71型中国分离株进行分析,并探索了中国分离株的可能进化途径,有助于肠道病毒71型及整个肠道病毒的基础研究和我国对于EV71所致疾病的预防.
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共 2 条
  • [1] 我国深圳地区手足口病患者肠道病毒71型的分离与鉴定
    何雅青
    杨帆
    李良成
    杨洪
    陈淑霞
    金奇
    [J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 1999, (01) : 83 - 84
  • [2] 医学分子病毒学.[M].金奇主编;.科学出版社.2001,