两个猪瘟病毒野毒株gp55基因抗原编码区序列的分析及比较

被引:13
作者
李红卫
涂长春
吕宗吉
金扩世
殷震
机构
[1] 长春农牧大学!长春,,长春农牧大学!长春,,佛山科学技术学院!广东佛山,长春农牧大学!长春,,长春农牧大学!长春,
基金
国家攀登计划;
关键词
猪瘟病毒; 野毒株; gp55基因; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
S852.651 [];
学科分类号
摘要
利用反转录-PCR方法扩增了吉林省猪瘟病毒(HCV)两个野毒株gp55基因的主要保护性抗原编码区,并将其克隆到pGEM-T载体中,然后用Sanger双脱氧法测定了其核苷酸序列,并推导了其氨基酸序列。将测定的这两个HCV野毒株的部分序列(350bp)与国内外已知的HCV序列进行比较,结果表明:这两个野毒株的核苷酸序列的同源性为94.9%,氨基酸序列同源性为97.4%,与1985~1992年意大利中部分离4个野毒株的同源性明显高于其它HCV毒株,核苷酸同源性分别为97.2%~98.3%和94.0%~949%,氨基酸同源性分别为98.3%~991%和97.4%~98.3%,而与我国的HCV标准强毒株即石门株的核苷酸同源性仅分别为83.1%和83.1%,氨基酸同源性仅分别为90.6%和91.4%。因此认为吉林省这两个野毒株与意大利中部的4个野毒株具有密切的关系,而与石门株很可能来源不同。
引用
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共 3 条
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    涂长春,李红卫,金扩世,章金钢,白安斌,刘士英,扈荣良,殷震
    [J]. 病毒学报, 1994, (01) : 33 - 38
  • [2] Usefulness and limitation of phylogenetic analysis for hepatitis C virus core region: application to isolates from Egyptian and Yemeni patients[J] . T. Ohno,M. Mizokami,M. G. Saleh,E. Orito,K. -I. Ohba,R. -R. Wu,T. Koide,C. J. Tibbs,K. T. Nouri-Aria,S. Tokudome,R. Williams.Archives of Virology . 1996 (6)
  • [3] Rapid characterization of new pestivirus strains by direct sequencing of PCR-amplified cDNA from the 5′ noncoding region[J] . Archives of Virology . 1994 (1)