中药黄草石斛rDNA ITS序列分析

被引:52
作者
徐红
李晓波
丁小余
王峥涛
徐珞珊
周开亚
机构
[1] 中国药科大学生药学研究室
[2] 南京师范大学遗传资源研究所
[3] 南京师范大学遗传资源研究所 江苏南京
[4] 江苏南京
关键词
石斛属; 黄草; ITS序列;
D O I
10.16438/j.0513-4870.2001.10.014
中图分类号
R284 [中药化学];
学科分类号
1008 ;
摘要
目的 研究黄草石斛ITS片段遗传多样性 ,分析该片段在黄草药材DNA分子鉴别和石斛属植物系统学研究中的意义。方法 用一对引物进行PCR扩增 ,扩增产物纯化后用双脱氧终止法 (Sangerdideoxy)测序。结果 获得核糖体DNA中ITS和 5 8SrDNA完整序列 ,14个石斛类群的ITS 1与ITS 2序列的长度分别为 2 2 8- 2 33bp和 2 42 -2 47bp。石斛种间ITS 1序列的差异百分率为 11 79% - 31 5 8% ,ITS 2序列的差异百分率为 10 2 9% - 2 5 30 % ,金钗石斛种内ITS 1序列的差异百分率为 0 87% ,ITS 2序列无差异。石斛各类群与外类群的差异百分率ITS 1序列为2 3 5 6 % - 36 89% ,ITS 2序列为 2 6 5 2 % - 33 31%。用NJ法根据ITS 1与ITS 2序列数据重建系统发生树。结论 两段序列在石斛种内保守 ,在种间有较大的差异 ,与外类群的差异最大 ,可作为中药黄草石斛分子鉴定的标记 ,而石斛属的系统发生关系尚须进一步研究
引用
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共 2 条
[1]  
Molecular phylogenetics of disease (Orchidaceae): A contribution from nuclear ribosomal ITS sequences. Douzery EJP, Pridgeon AM, Kores P, et al. American Journal of Botany . 1999
[2]  
The status and prospects of DNA fingerprinting and sequencing in the study of Chinese drug quality. Cao H, Liu YP, Shaw PC, et al. China Journal of Chinese Materia Medica . 1998