阐述了近年来医疗机构运行出现的新特点,即《中共中央、国务院关于卫生改革与发展的决定》实施后,大医院在国家重点扶持和技术优势的作用下,困难有所缓解;农村基层卫生机构由于国家投入的重点倾斜,合作医疗制度的重建和乡村两级卫生机构一体化的推行,困难也开始减轻,唯独处在中间层次的医院和一些企业医院的困境没有改善。指出现阶段医疗改革应在继续抓好上下两头的同时,对整个医疗系统的改革与发展问题做全盘考虑,制订出一个整体的全面改革方案,在分析中间层次医疗机构困难增多的根本原因的基础上,提出了深化医疗机构改革的新思路,即根据我国卫生事业发展状况,充分考虑世界卫生革命形势和我国经济社会发展趋势及人民群众对健康的需求,着眼于全面提高医疗工作整体素质和医疗保健水平,对医疗结构进行战略性调整。