广州市2009年新出现登革3型病毒的分子流行病学分析

被引:7
作者
狄飚
白志军
王玉林
罗雷
陈妤
蒋力云
杨智聪
王鸣
机构
[1] 广州市疾病预防控制中心
关键词
登革病毒; E基因; 系统进化树;
D O I
暂无
中图分类号
R181 [流行病学基本理论与方法]; R51 [传染病];
学科分类号
100401 ;
摘要
目的对广州市2009年新出现的3型登革病毒(DEN)株的E基因进行RT-PCR扩增和序列测定,探讨其来源及基因型。方法收集广州市2009年登革热患者急性期血清,用C6/36细胞培养分离DEN,RT-PCR扩增病毒全长E基因,测序并绘制系统进化树,结合流行病学资料进行分子流行病学分析。结果 2009年采集的19份患者血清标本中,分离到7株3型DEN株,RT-PCR扩增后测序获得E基因序列,7株DEN3病毒E基因均由1479个碱基组成,编码493个氨基酸,基因序列未见插入或缺失,分析发现7株病毒来自两个不同的亚型:09/GZ/1081、09/GZ/1483和09/GZ/10806属于东南亚/南太平洋型,09/GZ/10616、09/GZ/11144、09/GZ/11194和09/GZ/13105属于印度次大陆型,各亚型群内毒株序列同源性较高。结论广州市2009年DEN3为输入性,分属两个基因型。
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