文本挖掘技术在整合蛋白与疾病关系资源中的应用

被引：4

作者：

徐昊 ^{[1
]}

陶林 ^{[1
]}

魏武 ^{[1
]}

贾佩琳 ^{[1
]}

丁祖泉 ^{[2
]}

曹志伟 ^{[1
]}

机构：

[1] 上海生物信息技术研究中心

[2] 同济大学生命与科学技术学院

来源：

生物信息学 | 2009年 / 7卷 / 01期

关键词：

文本挖掘; 蛋白质; 疾病; 网络效应;

D O I：

暂无

中图分类号：

TP311.13 [];

学科分类号：

1201 ;

摘要：

为了整合文献中大量的人类蛋白质与疾病相互关系的信息,通过文本挖掘和通路分析的方法从PubMed中的摘要提取出对应关系后,利用KEGG中的通路信息构建出人类蛋白质和疾病相互的一个网络效应,并构建了查询数据库,用户可以根据蛋白质名称、疾病名称、通路名称来进行多方面的查询。

引用

页码：21 / 24

页数：4

共 7 条

[1]

Online Mendelian Inheritance in Man‘OMIM’. Amladi,S. Indi-an J Dermatol Venereol Leprol . 2003

[2]

KEGG: Kyoto encyclopedia of genes and genomes. Kanehisa,M,Goto,S. Nucleic Acids Research . 2000

[3]

A public Database for Gene Expression in Human Cancers. Lal A,et al. Cancer Research . 1999

[4]

The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003. Boeckmann,B,Bairoch,A,Apweiler,R,Blatter,MC,Estreiche,A,Gasteiger,E,Martin,MJ,Michoud,K,O’Donovan,C,Phan,I. Nucleic Acids Research . 2003

[5]

The Protein Data Bank. Berman H.M,Westbrook J.,Feng Z.et al. Nucleic Acids Research . 2000

[6]

The MeSH translation maintenance system: structure, interface design, and implementation. Nelson S. J.,Schopen M.,,Savage A. G. et al. Medinfo . 2004

[7]

KEGG for linking genomes to life and the envir-onment. Kanehisa,M.et al. Nucleic Acids Research . 2007

← 1 →