浙江省流行性感冒病毒分离株HA1基因分析

目的研究浙江省近2年新分离的甲3型流行性感冒（流感）病毒株血凝素HA1基因特性,以了解浙江省流感病毒变异情况和WHO推荐疫苗株对人体的保护情况。方法采集浙江省近2年类流感病人的咽拭子和含漱液标本进行流感病毒的分离,对分离到的甲3型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNA MAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对。结果近2年新分离到的甲3型流感病毒株HA1区域的核苷酸序列长度均为987bp,未发现核苷酸的丢失和插入,相应的点突变率为0.8%1.3%,推导的氨基酸序列长度均为329个。2003年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A/Moscow/10/99比较,核苷酸同源性只有95.6%95.9%,氨基酸总变异达20个,发生在抗原决定簇A、B区的有6个位点。2004年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A/fujian/411/2002（A/Ku-mamoto/102/2002,A Wyoming/3/2003）比较,核苷酸同源性达98.6%99.1%,仅发生3～6个氨基酸的变异。基因进化树上,浙江省2003,2004年新分离的毒株均属于同一类性状的毒株,与2004年WHO推荐疫苗株接近,已远离2003年推荐疫苗株。结论浙江省甲3型流感病毒的抗原性已发生漂移,与我省流感的流行密切相关。2003年WHO推荐使用的甲3型流感疫苗对我省甲3型流感的预防效果不够理想,2004年推荐使用的疫苗对我省甲3型流感的预防效果较好。