云南江城和黑井盐矿沉积物未培养放线菌多样性比较

被引：16

作者：

吴晋元 ^{[1
]}

职晓阳 ^{[1
]}

李岩 ^{[1
]}

关统伟 ^{[2
]}

唐蜀昆 ^{[1
]}

徐丽华 ^{[1
]}

李文均 ^{[1
]}

机构：

[1] 云南大学云南省微生物研究所教育部微生物多样性可持续利用重点实验室

[2] 塔里木大学新疆兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室

来源：

微生物学通报 | 2008年 / 10期

关键词：

盐矿; 极端环境; 放线菌多样性; 免培养技术;

D O I：

10.13344/j.microbiol.china.2008.10.005

中图分类号：

Q93 [微生物学];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

类群特异性引物的应用使得研究者可以对感兴趣的微生物类群进行针对性研究。围绕云南江城和黑井两个地区的3个盐矿样点沉积物中放线菌的多样性和群落组成,我们通过放线菌特异性引物对总DNA进行16SrRNA基因扩增,经过克隆文库构建,利用酶切并选择其中不同带型的133个克隆的16SrRNA基因插入片段进行测序。系统发育分析和统计学结果表明,两地放线菌16SrRNA基因克隆广泛分布于整个放线菌门,同时发现部分序列可能属于放线菌的新类群。分析结果还预示,江城和黑井两地盐矿虽处云南不同地域含盐区,但两地未培养放线菌物种多样性和系统发育关系均较为相似。

引用

页码：1550 / 1555

页数：6

共 11 条

[1] 放线菌——微生物药物的重要资源 [J].

刘志恒 .

微生物学通报, 2005, (06) :143-145

[2] 土壤微生物分子生态学研究中总DNA的提取 [J].

赵勇 ;

周志华 ;

李武 ;

刘彬彬 ;

潘迎捷 ;

赵立平 .

农业环境科学学报, 2005, (05) :24-30

[3] 嗜盐菌的研究新进展 [J].

刘会强 ;

张立丰 ;

韩彬 ;

迪里拜尔.托乎提 .

新疆师范大学学报(自然科学版), 2005, (03) :84-88

[4] 云南腾冲热海三热泉细菌多样性的研究 [J].

李沁元 ;

崔晓龙 ;

张东华 ;

彭谦 ;

徐丽华 ;

王涛 ;

柴丽红 ;

姜成林 ;

不详 .

微生物学通报 , 2004, (05) :49-54

[5] 未培养微生物的研究与微生物分子生态学的发展 [J].

叶姜瑜 ;

罗固源 ;

不详 .

微生物学通报 , 2004, (05) :111-115

[6] 新疆青海中度嗜盐放线菌生物多样性初步研究 [J].

李文均 ;

唐蜀昆 ;

王栋 ;

徐丽华 ;

姜成林 .

微生物学报, 2004, (01) :1-7

[7] Estimating and comparing the diversity of marine actinobacteria [J].

Stach, JEM ;

Bull, AT .

ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, 2005, 87 (01) :3-9

[8]

Brines and evaporites: analogs for Martian life[J] . R.L. Mancinelli,T.F. Fahlen,R. Landheim,M.R. Klovstad.Advances in Space Research . 2004 (8)

[9]

New primers for the class Actinobacteria: application to marine and terrestrial environments[J] . James E. M.Stach,Luis A.Maldonado,Alan C.Ward,MichaelGoodfellow,Alan T.Bull.Environmental Microbiology . 2003 (10)

[10]

Microbial Evolution, Diversity, and Ecology: A Decade of Ribosomal RNA Analysis of Uncultivated Microorganisms[J] . I.M. Head,J.R. Saunders,R.W. Pickup.Microbial Ecology . 1998 (1)

← 1 2 →