MS-HRM检测游离甲基化SEPT9在结直肠癌早期诊断中的应用

被引:6
作者
王侦 [1 ]
陈嘉昌 [2 ]
何琼 [3 ]
彭焕玉 [2 ]
朱振宇 [1 ]
陈华云 [2 ]
李明 [4 ]
机构
[1] 中山大学中山医学院
[2] 中山大学达安基因诊断中心
[3] 中山大学附属第三医院病理科
[4] 南方医科大学生命科学院
基金
广州市科技计划项目;
关键词
结直肠癌; SEPT9; 甲基化; 高分辨率熔解曲线; MS-HRM;
D O I
10.13820/j.cnki.gdyx.2012.12.061
中图分类号
R735.3 [肠肿瘤];
学科分类号
100112 [医学生物化学与分子生物学];
摘要
目的建立一种稳定的甲基化敏感高分辨率熔解曲线(MS-HRM)定量检测血浆游离甲基化SEPT9的方法,并初步探讨利用此方法进行结直肠癌早期诊断的可行性。方法按照不同比例混合甲基化和未甲基化DNA建立标准品,复管反应作出标准熔解曲线,定量检测36例结直肠癌患者血浆样本和20例正常人血浆样本甲基化SEPT9,并与Methylight进行比较。梯度稀释其中1例结直肠癌血浆游离DNA,分析其甲基化程度与DNA量是否独立。随机取2例结直肠癌样本重复甲基化修饰至MS-HRM分析,以排除修饰不完全对实验结果的影响。结果 SEPT9 MS-HRM法可检出混合甲样本中1%的甲基化,其检测灵敏度达1%。36例结直肠癌患者血浆中检测到25例(69.44%)有不同程度SEPT9基因甲基化,20例正常人血浆样本有2例(10%)呈现1%~5%甲基化。不同DNA量甲基化程度恒定,初步确定检测范围可达皮克级DNA。2例独立重复检测样本检测结果基本符合初次实验结果。结论 MS-HRM法检测游离的甲基化SEPT9简单易行,快速,稳定,敏感性高,检测样本范围广,有望为结直肠癌筛查开拓一个新平台。
引用
收藏
页码:1732 / 1734
页数:3
相关论文
共 4 条
[1]
Limitations and advantages of MS-HRM and bisulfite sequencing for single locus methylation studies [J].
Wojdacz, Tomasz K. ;
Moller, Tine Horning ;
Thestrup, Britta Boserup ;
Kristensen, Lasse Sommer ;
Hansen, Lise Lotte .
EXPERT REVIEW OF MOLECULAR DIAGNOSTICS, 2010, 10 (05) :575-580
[2]
High Quality Assessment of DNA Methylation in Archival Tissues from Colorectal Cancer Patients Using Quantitative High-Resolution Melting Analysis [J].
Balic, Marija ;
Pichler, Martin ;
Strutz, Jasmin ;
Heitzer, Ellen ;
Ausch, Christoph ;
Samonigg, Hellmut ;
Cote, Richard J. ;
Dandachi, Nadia .
JOURNAL OF MOLECULAR DIAGNOSTICS, 2009, 11 (02) :102-108
[3]
Primer design versus PCR bias in methylation independent PCR amplifications [J].
Wojdacz, Tomasz K. ;
Borgbo, Tanni ;
Hansen, Lise Lotte .
EPIGENETICS, 2009, 4 (04) :231-234
[4]
Precision and performance characteristics of bisulfite conversion and real-time PCR (MethyLight) for quantitative DNA methylation analysis [J].
Ogino, Shuji ;
Kawasaki, Takako ;
Brahmandam, Mohan ;
Cantor, Mami ;
Kirkner, Gregory J. ;
Spiegelman, Donna ;
Makrigiorgos, G. Mike ;
Weisenberger, Daniel J. ;
Laird, Peter W. ;
Loda, Massimo ;
Fuchs, Charles S. .
JOURNAL OF MOLECULAR DIAGNOSTICS, 2006, 8 (02) :209-217