分子动力学模拟中不同短程作用力计算方法的效率研究

被引：4

作者：

吴江涛

刘志刚

赵小明

机构：

[1] 西安交通大学能源与动力工程学院

来源：

西安交通大学学报 | 2002年 / 05期

关键词：

分子动力学; 分子间短程作用力; Verlet链法; 链格法;

D O I：

暂无

中图分类号：

O552.4 [液体分子运动论];

学科分类号：

摘要：

利用分子动力学模拟的基准问题 ,对截断半径 (cut offdistance)法、Verlet链 (Verletlist)法和链格 (linked cell)法等分子间短程作用力的计算方法与模拟系统的粒子数、对比密度之间的关系进行了研究 .研究结果表明 ,各计算方法的效率与模拟系统的对比密度、粒子数量有密切关系 .在粒子数为 16 384时 ,若对比密度为 0 9,linked cell法的计算效率是截断半径法的 18倍 ,若对比密度为 0 1,两者的效率则相差 10 0倍 ;在粒子数超过 86 4以后 ,linked cell法具有明显的优势 .计算结果可以为合理评价分子动力学并行算法的效率和加速比等指标提供依据

引用

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