生物信息学用于代谢网络研究的进展与展望

被引:14
作者
何锋
马红武
赵学明
元英进
曾安平
机构
[1] 天津大学化工学院
[2] 天津大学化工学院 天津
[3] 天津 GBF-German Research Center for Biotechnology
[4] Mascheroder Weg
[5] Braunschweig
[6] Germany
[7] 天津
[8] 不详
关键词
生物信息学; 基因组学; 代谢网络; 代谢途径; 基元模式; 极端途径;
D O I
暂无
中图分类号
Q-33 [生物学实验与生物学技术];
学科分类号
摘要
如何分析基因测序和高通量分析方法所获得的海量数据和信息 ,及由此而得到的复杂生物网络 ,是生物信息学研究者所面临的重要任务 .本文综述了基于基因组的大规模代谢网络重建和分析的进展 ,论述了利用生物信息学方法分析代谢网络结构的主要方法和结果 ;比较了现阶段两种最常用的代谢途径分析方法 ,即基元模式和极端途径的差异 ;列举了这两种方法在代谢网络结构和功能分析、工程菌设计等多方面的重要应用 ;指出了现阶段在途径分析领域存在的问题和应对的策略 .
引用
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页码:1593 / 1601
页数:9
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共 3 条
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  • [2] 代谢工程[M]. 化学工业出版社 , (美)GregoryN.Stephanopoulos等著, 2003
  • [3] Network biology: understanding the cell’s functional or-ganization .2 Barabasi A-L,Oltvai Z N. Nature Reviews Genetics . 2004