桃基因组中R类抗病基因同源序列的克隆与序列分析

被引:20
作者
梁凤山
周春江
孔凡娜
王斌
机构
[1] 中国科学院遗传与发育生物学研究所,中国科学院遗传与发育生物学研究所,中国科学院遗传与发育生物学研究所,中国科学院遗传与发育生物学研究所北京河北农业大学农学院河北保定,北京,北京,北京
关键词
桃; 核苷酸结合位点; 抗病基因; 同源序列;
D O I
暂无
中图分类号
S662.1 [桃];
学科分类号
090201 [果树学];
摘要
许多抗病基因均具有核苷酸结合位点(NBS)和富含亮氨酸重复区(LRR)。根据已知的NBS-LRR型抗病基因蛋白质的保守序列,设计简并引物,用以扩增桃基因组中的抗病基因同源序列。获得一条大小约500 bp的扩增片段,克隆测序后得到4个NBS-LRR类抗病基因同源片段(PNBS1、PNBS2、PNBS3、PNBS4)。推导的氨基酸均具有P-loop(激酶1a)保守区和中间的激酶2a、激酶3a保守区,除PNBS4外,均具有3端疏水结构域。它们与已克隆的N、L6、PRS2 等抗病基因在核苷酸水平上的同源性为21 1%58 8%;在氨基酸水平上的同源性为18 8%41 4%。这些抗病基因同源片段(RGA)可做为分子标记筛选桃的抗病候选基因。
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