基于复杂网络的时延基因调控网络构建

被引:4
作者
王雪松
谷阳阳
程玉虎
机构
[1] 中国矿业大学信息与电气工程学院
基金
中国博士后科学基金;
关键词
复杂网络; 时延; 基因调控网络; 社团;
D O I
暂无
中图分类号
TP393.02 [];
学科分类号
摘要
借鉴复杂网络的分析思想和方法,采用规范化Laplace矩阵和K均值聚类法对基因调控网络进行多社团划分,同时给出每个社团内部和社团之间基因的相互作用情况.另外,为反映基因之间真实的相互作用过程和提高建模精度,在社团划分之前,采用时间序列谱分析法对基因表达时延进行精确估计.酵母细胞周期基因调控关系分析的实验结果表明,本文所提方法能更准确地反映基因之间的相互作用过程和提供基因调控模型的细节.
引用
收藏
页码:2518 / 2522
页数:5
相关论文
共 6 条
[1]   基于拉普拉斯图谱和K均值的多社团发现方法 [J].
杨建新 ;
周献中 ;
葛银茂 .
计算机工程, 2008, (12) :178-180+183
[2]   基于基因表达谱的肿瘤预测模型研究 [J].
李辉 ;
王金莲 .
电子学报, 2008, (05) :989-992
[3]   延迟基因调控网络重构问题研究 [J].
张宏怡 ;
张军英 .
西安电子科技大学学报, 2007, (05) :809-813
[4]   基于复杂网络的软件复杂性度量研究 [J].
李兵 ;
王浩 ;
李增扬 ;
何克清 ;
余敦辉 .
电子学报, 2006, (S1) :2371-2375
[5]   相关分析在建立基因调控网络中的应用 [J].
易东 ;
杨梦苏 ;
李辉智 ;
黄明辉 ;
王文昌 .
中国卫生统计, 2003, (03) :17-19
[6]   Spectral reconstruction of complex networks [J].
Comellas, Francesc ;
Diaz-Lopez, Jordi .
PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS, 2008, 387 (25) :6436-6442