三维凝胶NAT2基因分型芯片的制备与优化

目的研制N-乙酰化酶2(NAT2)基因分型芯片,以快速、准确检测患者的NAT2单核苷酸基因多态性。方法设计并合成中国人中常见的NAT2酶基因5个突变位点的探针对和包含5个突变位点的两对引物;样本经PCR扩增后,采用丙烯酰胺点样液制备芯片,并与TEMED反应固化芯片;分别用探针与芯片杂交,采用博奥晶芯LUXSCAN10K微阵列芯片扫描仪分析结果。结果优化了PCR扩增条件,使两组PCR在相同条件下扩增;优化了芯片制备及杂交条件,双链DNA采用碱变性,清除非特异键合采用电泳方法;建立了NAT2酶基因分型标准:信号强度Cy3∶Cy5≥5为野生型,Cy3∶Cy5为0.6～1.5时为杂合子,Cy3∶Cy5≤0.2为突变型;对20例标本的基因分型结果采用直接测序法进行验证,结果均一致。结论三维凝胶NAT2基因点突变分型芯片法是一种特异性强、高通量的NAT2基因分型方法,适用于临床快速基因分型,指导相关药物合理使用。