肿瘤基因表达谱分类特征基因选取问题及分析方法研究

被引：45

作者：

李颖新

李建更

阮晓钢

机构：

[1] 北京工业大学电子信息与控制工程学院

来源：

计算机学报 | 2006年 / 02期

关键词：

肿瘤; 基因表达; 特征基因; 组织分类; 特征选取; 支持向量机;

D O I：

暂无

中图分类号：

TP399 [在其他方面的应用];

学科分类号：

摘要：

对肿瘤分类特征基因选取问题的研究是发现肿瘤特异表达基因、研究肿瘤基因表达模式的重要手段.文中基于多类别肿瘤基因表达谱数据集,从研究肿瘤与正常组织的分类入手,对肿瘤分类特征基因选取问题进行分析和研究.首先对基于Relief算法的特征选取策略加以改进生成候选特征集合;然后以支持向量机作为分类器对其分类性能进行检验以选取分类特征基因;最后结合分类模型,利用灵敏度分析方法进行特征基因的精确搜索以滤除冗余.基于该方法文中选出了52个具有良好分类性能的特征基因作为肿瘤的基因特征,并对其表达行为进行了简要分析.

引用

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