随机森林方法预测膜蛋白类型

被引：35

作者：

袁敏

胡秀珍

机构：

[1] 内蒙古工业大学理学院

来源：

生物物理学报 | 2009年 / 25卷 / 05期

关键词：

生物膜蛋白; 随机森林法; 离散增量; 离散傅里叶谱; 伪氨基酸组分;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q51 [蛋白质];

学科分类号：

070307 [化学生物学];

摘要：

膜蛋白的类型与其功能是密切相关的,因此膜蛋白类型的预测是研究其功能的重要手段,从蛋白质的氨基酸序列出发对膜蛋白的类型进行预测有重要意义。文章基于蛋白质的氨基酸序列,将组合离散增量和伪氨基酸组分信息共同作为预测参数,采用随机森林分类器,对8类膜蛋白进行了预测。在Jackknife检验下的预测精度为86.3%,独立检验的预测精度为93.8%,取得了好于前人的预测结果。

引用

页码：349 / 355

页数：7

共 14 条

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