水稻突变群体的构建及功能基因组学

被引：30

作者：

江树业

机构：

[1] 福建农林大学作物科学学院

来源：

分子植物育种 | 2003年 / 02期

关键词：

水稻; 突变体; 功能基因组学;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511 [稻];

学科分类号：

摘要：

随着水稻基因组全序列的测定完成 ,功能基因组学已成为重点研究内容。功能基因组学主要研究生物有机体内各基因的生物学功能进而了解所有基因如何协调发挥作用完成一系列的生长发育过程。目前已经发展了多种分析鉴定基因功能的方法 ,其中最直接最有效的方法是构建饱和的基因突变群体 ,通过突变体分析鉴定基因功能。本文主要阐述了各种构建方法及其优缺点以及在功能基因分离鉴定上的应用。自发突变的频率极低 ,且自发突变基因的分离难度比较大 ,只能作为突变群体构建的辅助方法。利用EMS等化学诱变剂可以在短时间内构建大量点突变群体 ,并可用TILLING进行突变检测 ,但多位点的点突变使突变表型难以鉴定。由快中子等物理诱变也可以在短时间内构建大量缺失突变体 ,且可用Deleteagene系统进行检测 ;但多基因缺失、多位点缺失和内含子缺失等使突变表型的分析可能无法进行。利用T -DNA、转座子和反转录转座子等构建插入突变体已经成为突变库构建的主要方法。T -DNA插入已成功应用于水稻大规模突变体的构建 ,但只限于转基因效率较高的品种 ;T -DNA在基因组中整合的复杂性以及转基因过程中由组织培养等引发的突变等 ,增加了突变体表型和分子分析的难度。Tos17是目前应用最为成功的反转录转座子 ,但多拷贝的插入

引用

页码：137 / 150

页数：14

共 18 条

[1]

A draft sequence of the rice (Oryza sativa ssp.indica) genome[J] . Jun Yu,Songnian Hu,Jun Wang,Songgang Li,Ka-Shu Gane Wong,Bin Liu,Yajun Deng,Li Dai,Yan Zhou,Xiuqing Zhang,Mengliang Cao,Jing Liu,Jiandong Sun,Jiabin Tang,Yanjiong Chen,Xiaobing Huang,Wei Lin,Chen Ye,Wei Tong,Lijuan Cong,Jianing Geng,Yujun Han,Lin Li,Wei Li,Guangqiang Hu,Xiangang Huang,Wenjie Li,Jian Li,Zhanwei Liu,Long Li,Jianping Liu,Qiuhui Qi,Jinsong Liu,Li Li,Xuegang Wang,Hong Lu,Tingting Wu,Miao Zhu,Peixiang Ni,Hua Han,Wei Do

[2]

Identification of an 85-kb DNA fragment containing pms1, a locus for photoperiod-sensitive genic male sterility in rice[J] . N. Liu,Y. Shan,F. Wang,C. Xu,K. Peng,X. Li,Qifa Zhang.Molecular Genetics and Genomics . 2001 (2)

[3] Molecular mapping of the reverse thermo-sensitive genic male-sterile gene (rtms1) in rice [J].

Jia, JH ;

Zhang, DS ;

Li, CY ;

Qu, XP ;

Wang, SW ;

Chamarerk, V ;

Nguyen, HT ;

Wang, B .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2001, 103 (04) :607-612

[4] A novel transposon tagging element for obtaining gain-of-function mutants based on a self-stabilizing Ac derivative [J].

Suzuki, Y ;

Uemura, S ;

Saito, Y ;

Murofushi, O ;

Schmitz, G ;

Theres, K ;

Yamaguchi, I .

PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 2001, 45 (02) :123-131

[5]

Tissue culture-derived variation in crop improvement[J] . S. Mohan Jain.Euphytica . 2001 (2)

[6]

Transgene silencing in monocots[J] . Lakshminarayan M. Iyer,Siva P. Kumpatla,Mahesh B. Chandrasekharan,Timothy C. Hall.Plant Molecular Biology . 2000 (2)

[7]

The Arabidopsis transposon Tag1 is active in rice, undergoing germinal transposition and restricted, late somatic excision[J] . D. Liu,S. Zhang,C. Fauquet,N. M. Crawford.MGG - Molecular and General Genetics . 1999 (3)

[8]

A comparison of BRCA1 mutation analysis by direct sequencing, SSCP and DHPLC[J] . E. Gross,N. Arnold,J. Goette,U. Schwarz-Boeger,M. Kiechle.Human Genetics . 1999 (1-2)

[9]

Identifying and mapping cDNA fragments related to rice photoperiod sensitive genic male sterility[J] . Shuye Jiang,Qifeng Chen,Xuanjun Fang.Chinese Science Bulletin . 2000 (6)

[10]

Identification of differentially expressed genes in photo-period sensitive genic male sterile rice by randomly amplified cDNAs using RAPD primers[J] . Shuye Jiang,Qifeng Chen,Xuanjun Fang.Chinese Science Bulletin . 1999 (4)

← 1 2 →