红树林土壤总DNA不同提取方法比较研究

被引:25
作者
杨建
洪葵
机构
[1] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带作物生物技术国家重点实验室
关键词
红树林土壤; DNA提取; 宏基因组; 分子生态学;
D O I
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2006.s1.081
中图分类号
S714 [森林土壤学];
学科分类号
0903 ; 090301 ;
摘要
获得高浓度、大片段、无偏好的土壤微生物总DNA是土壤微生物分子生态学研究和宏基因组文库构建的基础。本研究采用了5种方法从红树林土壤中提取DNA,并对5种方法提取出的DNA的质量和产量进行比较评价。结果表明,5种方法均可从土壤中提取到DNA,但不同方法提取到DNA的产量和质量存在明显差异。Bio101FastPrep?SPINKit(forSoil)抽提到的DNA得率最高,适合分子生态学研究;SDS-GITC-PEG法提取的DNA纯度最高,所得到的DNA片段较大(>48kb),有利于构建宏基因组文库。
引用
收藏
页码:366 / 371
页数:6
相关论文
共 4 条
[1]   九龙江口红树林土壤微生物的类群及抗菌活性 [J].
林鹏 ;
张瑜斌 ;
邓爱英 ;
庄铁诚 .
海洋学报(中文版), 2005, (03) :133-141
[2]   宏基因组克隆——微生物活性物质筛选的新途径 [J].
阎冰 ;
洪葵 ;
许云 ;
马超 .
微生物学通报, 2005, (01) :113-117
[3]  
Nucleic Acids in the Environment:Methods and Applications .2 L.R.Bakken,V.Lindahl. pringer-Verlag,Heidelberg . 1995
[4]  
Gabor E M,Cries E J,Janssen D B. FEMS Microbiology Ecology . 2003