水貂肠炎病毒B株全基因克隆与序列分析

被引:6
作者
陈涛 [1 ,2 ,3 ]
赵建军 [1 ]
张海玲 [1 ]
吴威 [1 ,3 ]
钱爱东 [2 ]
闫喜军 [1 ]
机构
[1] 中国农业科学院特产研究所
[2] 吉林农业大学动物科学技术学院
[3] 吉林中特生物技术有限责任公司
关键词
水貂肠炎病毒; NS1基因; VP2基因; 序列分析;
D O I
10.13327/j.jjlau.2010.01.021
中图分类号
S852.65 [家畜病毒学];
学科分类号
090601 ;
摘要
将水貂肠炎病毒基因组分4个重叠片段进行PCR扩增,并将产物克隆到pMD18-T载体中,测定基因组近全长序列。其中编码水貂肠炎病毒非结构蛋白基因(NS1基因)全长为2 007 bp,编码668个氨基酸;编码结构蛋白基因(VP2基因)全长为1 755 bp,编码584个氨基酸。序列分析结果表明:水貂肠炎病毒B株与犬细小病毒、猫泛白细胞减少症病毒NS1序列之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.8%~99.2%和98.8%~99.2%,与其他细小病毒毒株VP2序列之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.5%~99.8%和97.8%~99.5%,与MEVantigenic type 2株在亲缘上有着最密切关系。
引用
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