Rps.viridis光合反应中心分子间相互作用对电子转移机理影响的理论研究

被引:1
作者
徐红
张汝波
张小东
屈正旺
张兴康
张启元
机构
[1] 分子动态与稳态结构国家重点实验室
[2] 分子动态与稳态结构国家重点实验室 分子科学中心
[3] 中国科学院化学研究所
[4] 北京
[5] 分子科学
关键词
细菌光合反应中心; 电子转移; 色素分子-氨基酸残基间相互作用; DFT;
D O I
暂无
中图分类号
Q945.11 [光合作用、碳素同化作用];
学科分类号
090302 ;
摘要
摘要 基于晶体结构并经QM/MM优化后的结构数据,用量子化学密度泛函(DFT,B3LYP)方法,在6-31G基组水平上,对紫色光合细菌Rhodoseudomonas(Rps.)viridis反应中心内,色素分子与蛋白质环境中氨基酸残基以及水分子间的配位及氢键等相互作用对反应中心原初电子转移反应机理的影响进行了探讨.结果表明:组氨酸残基的轴向配位使色素分子的ELUMO显著升高,这对电子转移能够进行极为重要;而氢键作用使色素分子的ELUMO有所降低,有利于说明电子转移由原初电子给体P沿L分支进行.文中结果支持电子转移反应为不经过辅助细菌叶绿素的一步过程.只将色素分子周围的蛋白质环境作为具有一定介电常数的均匀介质来处理是远远不够的
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共 3 条
[1]   细菌光合反应中心突变体原初电子转移机理的理论研究 [J].
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马淑华 ;
徐红 ;
沈玲玲 ;
张兴康 ;
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化学学报, 2000, (12) :1576-1581
[2]   Theoretical studies on the mechanism of primary electron transfer in the photosynthetic reaction center of Rhodobacter sphaeroides [J].
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Zhang, RB ;
Ma, SH ;
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PHOTOSYNTHESIS RESEARCH, 2002, 74 (01) :11-36
[3]  
Excited states of the bacteriochorophyll b dimer of Rhodopseudomonas viridis : A QM/MM study of the photosynthetic reaction center that includes MM polarization .2 Thomopson M A,Schenter G K. J Phys Chem . 1995