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新疆乌鲁木齐HIV-1流行毒株膜蛋白基因C2-V3区序列测定和亚型分析
被引:13
作者:
白旭华
管永军
张远志
邵一鸣
王冬莉
苏玲
刘小良
赵全壁
杜大卫
JosefKostler
HansWolf
机构:
[1] 新疆维吾尔自治区卫生防疫站
[2] 中国预防医学科学院艾滋病参比实验室
[3] 新疆乌鲁木齐市卫生防疫站
[4] 德国累根斯堡大学医学微生物学研究所
来源:
关键词:
HIV-1,C亚型,序列测定,新疆;
D O I:
10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001065
中图分类号:
R512.91 [获得性免疫缺陷综合征(AIDS艾滋病)];
学科分类号:
摘要:
应用PCR方法对7份1996年3-5月采集于新疆乌鲁木齐HIV-1阳性静脉吸毒者的外周血单核细胞(PBMCs)样品进行扩增,获得了HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2-V3区及邻区350-450个核苷酸序列进行了测定和分析。研究结果表明,7份样品都为C亚型的HIV-1毒株序列,其组内的基因离散率为1.0%;与A-E参考亚型及部分C亚型代表株序列相比较,这7个毒株与代表印度C亚型毒株及云南德宏州C亚型毒株的序列十分相似,其组间的基因离散率均为3.5%,与非洲C亚型毒株nof的基因离散率为14.0%。根据以上数据及其它资料提示,HIV-1在新疆乌鲁木齐的流行时间不长,且其毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关。
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