无锡一起诺如病毒感染性腹泻病原基因测序分析

被引：5

作者：

冯微宏

肖勇

管红霞

凌霞

钱燕华

机构：

[1] 无锡市疾病预防控制中心检验部

来源：

环境与健康杂志 | 2012年 / 29卷 / 04期

关键词：

诺如病毒; 半巢氏RT-PCR; 进化树分析;

D O I：

10.16241/j.cnki.1001-5914.2012.04.035

中图分类号：

R440 [];

学科分类号：

100208 ;

摘要：

目的对无锡一起诺如病毒急性胃肠炎疫情进行病原基因测序分析,以确证其病原体,并对其基因进行分型。方法采用荧光定量PCR法对74份疫情病例样本进行诺如病毒RNA检测,在阳性标本中取3份病毒样本和1份日常监测检出的诺如病毒Ⅱ型阳性标本,经RT-PCR扩增,然后纯化、测序和进化树分析。结果 74份疫情样本中的17份样本测出诺如病毒Ⅱ型RNA,阳性率23%;其中3株疫情病毒和1株日常哨点医院腹泻病监测所得的Ⅱ型诺如病毒的ORF1-ORF2连接区序列与DNA Data Bank of Japan(DDBJ)中的GII.4参考株Lordsdale病毒(Lordsdale virus,LV)同源性最高,达95%。结论序列测定结果证实这起无锡急性胃肠炎疫情是诺如病毒感染所致,其病毒基因型为GⅡ.4型。

引用

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