培养方法对土壤可培养细菌多样性的影响

被引:16
作者
王萍 [1 ]
崔中利 [1 ]
刘标 [2 ]
孙波 [3 ]
曹慧 [1 ]
机构
[1] 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
[2] 国家环境保护部南京环境科学研究所
[3] 中国科学院南京土壤研究所
关键词
微生物多样性; 可培养性; RFLP分析; 培养基; 培养时间;
D O I
暂无
中图分类号
S154.34 [土壤微生物生物物理、生化与生理];
学科分类号
090301 [土壤学];
摘要
提高土壤微生物的可培养性,获得纯培养微生物菌株,是微生物生态学研究的基础。采用三种培养基对土壤细菌进行分时段计数,以细菌通用引物扩增细菌16S rDNA片段,用限制性内切酶HhaI酶切PCR产物,对酶切图谱进行分型,研究不同培养方法对土壤细菌多样性和可培养的影响。结果表明,LB、CSEA、W SA培养基192 h后每g干土获得的细菌数量分别为14.84×107、10.27×107和6.91×107CFU,但微生物多样性指数以W SA为最高,LB多样性指数最低;三种培养基培养的细菌菌群有一定的相似性,LB和CSEA培养基间的Jaccard指数为57.69%,LB和W SA培养基之间为53.13%,而CSEA和W SA培养基的相似性指数达66.67%;16S rDNA测序结果表明,所获得的土壤细菌优势种群在分类方面主要属于γ-和β-变形杆菌以及放线菌亚门,其中某些OTUs中的16S rDNA序列与Burkholderiaceae bacterium、Rhodococcus和Mycobac-terium属具有较高的同源性,推测其细胞能够分泌复苏促进因子,有效地提高土壤细菌的可培养性。
引用
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页码:1096 / 1101
页数:6
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