拟南芥TAK蛋白激酶的结构预测与功能分析

被引:7
作者
蒋佳宏 [1 ]
王东 [1 ]
胡源 [1 ]
杜林方 [1 ,2 ]
机构
[1] 四川大学生物资源与生态环境教育部重点实验室
[2] 四川大学纳米生物医学技术与膜生物学研究所
关键词
TAK; 磷酸化; LHCII; 核心结构域; 同源建模; 抗体;
D O I
暂无
中图分类号
Q946 [植物生物化学];
学科分类号
071001 [植物学];
摘要
TAK1、TAK2和TAK3属于TAK蛋白激酶家族,由拟南芥核基因编码,其中TAK1参与了主要捕光色素复合物LHCⅡ蛋白磷酸化调控与光系统的状态转移.本文使用生物信息学手段对TAK1、TAK2和TAK3蛋白进行了较为系统的分析,发现TAK1、TAK2和TAK3为单次跨膜蛋白,具有保守的激酶活性域、疏水性强的N端跨越类囊体膜、亲水性高的C端处于基质中等特点.在PDB中找到了不少与TAK1、TAK2和TAK3同源性大于30%的蛋白序列,其中大部分也带有酪氨酸激酶保守域,使用同源建模的方法,建立了拟南芥蛋白激酶TAKs核心结构域的三维结构,围绕蛋白激酶的结构和作用机制关系进行了探讨,设计出多肽抗体,并进行蛋白印迹检测抗体的专一性,为TAKs蛋白激酶进一步的功能研究奠定了基础.图5表1参15
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