利用抑制差减杂交技术分离茄子单性结实相关ESTs

被引:6
作者
周亚君 [1 ]
陈钰辉 [1 ]
刘富中 [1 ]
张映 [1 ,2 ]
连勇 [1 ]
机构
[1] 中国农业科学院蔬菜花卉研究所
[2] 中国农业大学农学与生物技术学院
关键词
茄子; 单性结实; 抑制差减杂交;
D O I
10.16420/j.issn.0513-353x.2010.12.022
中图分类号
S641.1 [茄子];
学科分类号
090202 ;
摘要
以茄子(Solanum melongena)单性结实品系D-10和非单性结实品系03-2的子房cDNA分别为试验组(Tester)和驱动组(Driver),利用抑制差减杂交(SSH)技术构建了正反两个SSH-cDNA文库,分别包含472和124个克隆。通过测序、序列拼接后,共获得384个Unique ESTs。将其与非冗余蛋白数据库进行BLASTx比对,在E值小于等于1e-10条件下,有257个ESTs能找到相匹配的蛋白质,其中121个ESTs与非冗余蛋白质数据库中已知功能的蛋白质具有高度的相似性。功能注释结果表明,具生物过程、分子功能和细胞组分的EST分别为107、102和119条。推测与单性结实相关的EST有5条:2条ESTs属于MADS-box转录因子家族,1条与生长素增长蛋白同源,1条属于P450还原酶系,1条属于MAPKK家族;另外136个ESTs代表了未知功能基因。
引用
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页码:1944 / 1952
页数:9
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