MLVA和Spoligotyping用于西藏地区216株结核分枝杆菌临床分离株的基因分型研究

目的评价间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）及多位点可变数量串联重复序列分析（MLVA）两种分型方法在西藏地区结核病分子流行病学中的应用。方法收集西藏地区结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）临床分离株,应用Spoligotyping及MLVA两种分型方法进行比较分析。结果共在西藏地区收集到216株结核分枝杆菌临床分离株,采用Spoligotyping分型方法,216株菌可分为3个基因群13种基因型,其中最大的1个基因群即北京家族（Beijing family）含有195株菌,占90.28%。北京家族菌株中,有BCG接种史者占45.64%（89/195）,无BCG接种史者占54.36%（106/ 1195）,两者间的差异无统计学意义（x2=0.059,P>0.05）。采用MLVA分型方法,216株菌可分成19个基因群108种基因型,其中80种基因型只有1株菌,占37.03%（80/216）,另有136株菌表现出28种基因型,成簇数为28,占62.96%（136/216）。在20个VNTR位点的等位基因多态性发现Miru31位点的多态性最高,多态性指数（h）达到0.77,而Mtub29、Mtub12位点的多态性较差,都低于0.05。其中Mtub02位点可鉴别北京家族和非北京家族,它鉴别的北京家族与Spoligotyping鉴别的北京家族符合率达到100%。结论西藏地区结核分枝杆菌具有明显的接引多态性,其主要流行型为北京家族。北京家族菌株与BCG接种无相关性。应用Spoligotyping和MLVA两种分型方法进行结核病流行病学研究,将提高结核病的流行病学调查和病原学监测效果。