癌症基因分类的Laplace谱方法

被引:2
作者
王年
庄振华
范益政
李学俊
王继
机构
[1] 安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室
关键词
分类; 基因表达谱数据; Laplace谱;
D O I
暂无
中图分类号
R730.2 [肿瘤病理学、病因学];
学科分类号
摘要
本文尝试着将图的Laplace谱理论应用于癌症基因表达谱数据的分类上.计算出训练集中每个类的均值作为类中心,选出与类中心欧式距离最小的若干样本用laplace矩阵构造完全图,记为代表该类的标准图.用待测样本依次替换标准图中所有的点,将生成的新图与标准图进行特征点匹配,并计算匹配点数总和.将待测样本划分为总匹配点数最多的那个类.通过对白血病两个亚型(ALL与AML)与结肠癌数据进行留一法实验,验证了本文方法的有效性.
引用
收藏
页码:1594 / 1597
页数:4
相关论文
共 8 条
[1]   基于微阵列基因表达谱的一种关联空间的癌症分类算法 [J].
卢新国 ;
林亚平 ;
王海军 ;
李小龙 ;
易叶青 .
电子学报, 2008, (04) :614-619
[2]   基于遗传算法的基因分类 [J].
蔡立军 ;
林亚平 ;
卢新国 ;
易叶青 ;
李小龙 .
电子学报, 2006, (11) :2115-2119
[3]   基于图的Laplace谱的特征匹配 [J].
王年 ;
范益政 ;
韦穗 ;
梁栋 .
中国图象图形学报, 2006, (03) :332-336
[4]   一种肿瘤基因表达数据的知识提取方法 [J].
李颖新 ;
刘全金 ;
阮晓钢 .
电子学报, 2004, (09) :1479-1482
[5]  
A Bayesian approach to nonlinear probit gene selection and classification[J] . Xiaobo Zhou,Xiaodong Wang,Edward R. Dougherty.Journal of the Franklin Institute . 2004 (1)
[6]   Gene expression correlates of clinical prostate cancer behavior [J].
Singh, D ;
Febbo, PG ;
Ross, K ;
Jackson, DG ;
Manola, J ;
Ladd, C ;
Tamayo, P ;
Renshaw, AA ;
D'Amico, AV ;
Richie, JP ;
Lander, ES ;
Loda, M ;
Kantoff, PW ;
Golub, TR ;
Sellers, WR .
CANCER CELL, 2002, 1 (02) :203-209
[7]   Gene Selection for Cancer Classification using Support Vector Machines [J].
Isabelle Guyon ;
Jason Weston ;
Stephen Barnhill ;
Vladimir Vapnik .
Machine Learning, 2002, 46 :389-422
[8]   Gene expression data analysis [J].
Brazma, A ;
Vilo, J .
FEBS LETTERS, 2000, 480 (01) :17-24