基于EST库的猕猴桃脂氧合酶基因家族成员的克隆

利用猕猴桃EST库及相关生物信息学手段,从果肉组织克隆了LOX基因家族成员6个,命名为AdLox1-6。AdLox1、AdLox2、AdLox3和AdLox4为全长cDNA,编码区长度分别为2739、2595、2739和2709bp,AdLox5和AdLox6为cDNA片段,长度为1359和1557bp。猕猴桃AdLox2和AdLox5氨基酸序列同源性最高,约74%,而AdLox3和AdLox5仅为49%。生物信息学分析表明,AdLox1、AdLox3、AdLox4和AdLox6可能具有13-LOX活性,在N端含有额外约60个氨基酸残基,而AdLox2和AdLox5则属于9-LOX类型。猕猴桃AdLox1与番茄TomLoxD具有最高氨基酸序列同源性(约80%),AdLox2和AdLox5与TomLoxA高度聚类,序列同源性分别为68%和75%,AdLox4和AdLox6与TomLoxC的氨基酸序列同源性分别为62%和63%,AdLox3与番茄LOX基因序列同源性低于55%。