碱性果胶裂解酶基因的克隆及核苷酸序列分析

被引:2
作者
翟超
曹军卫
机构
[1] 武汉大学生命科学学院!湖北武汉
关键词
碱性果胶裂解酶; 嗜碱芽孢杆菌; 克隆; 核苷酸序列分析;
D O I
10.14188/j.1671-8836.2001.02.017
中图分类号
Q785 [转化及克隆];
学科分类号
071007 ; 0836 ; 090102 ;
摘要
以 p Bluescript KS(M13- )质粒作为载体构建嗜碱芽孢杆菌 NTT33的基因组文库 .在 YC平板上筛选到一株含果胶裂解酶 (pectate lyase,pel)基因的大肠杆菌阳性克隆子 .酶切后 ,电泳鉴定 ,插入的外源片段约 6 .5kb.通过引物步行法测定了含有该基因的约 3kb左右的外源 DNA片段的核苷酸序列 .经 PCgene软件分析发现第 15 0~ 116 0 bp编码一个由 337个氨基酸组成的蛋白质分子 .根据果胶裂解酶的等电点分类方法推断 ,其属于Pel A.将其与 Genebank中现有的基因编码的氨基酸序列进行同源比较 ,发现它与 Bacillus sp.Ksm SM- P15的Pel E和 Azospirillum irakense的 Pel A的同源性分别为 38%和 32 % .这 3种酶与其它果胶裂解酶的基因同源性很低 ,所以推测它们很可能属于一个新的果胶裂解酶家族
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共 2 条
[1]  
Resolution of four pectate lyase structural genes of Erwinia chrysanthemi (EC16) and characterization of the enzymes produced in Escherichia coli[J] . Frederic Barras,Kerry K. Thurn,Arun K. Chatterjee.MGG Molecular & General Genetics . 1987 (2)
[2]  
Sambrook,J,Fritsch,EF,Maniatis,T. Molecular Cloning: A laboratory Manual . 1989