传统中药中H7N9病毒神经氨酸酶抑制剂的计算机虚拟筛选

被引：12

作者：

史海龙 ^{[1
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崔亚亚 ^{[1
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李军 ^{[1
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王玉成 ^{[1
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李贤杨 ^{[1
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陈哲 ^{[1
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肖磊 ^{[1
]}

机构：

[1] 陕西中医药大学

[2] 西北大学生命科学学院

来源：

中国实验方剂学杂志 | 2015年 / 21卷 / 24期

关键词：

H7N9流感病毒; 神经氨酸酶; 计算机虚拟筛选; 中药;

D O I：

暂无

中图分类号：

R2-03 [中医现代化研究];

学科分类号：

100112 [医学生物化学与分子生物学];

摘要：

目的:运用计算机虚拟筛选技术从传统中药数据库(TCM database@Taiwan)中快速搜索H7N9亚型流感病毒神经氨酸酶(neuraminidase,NA)的中药小分子抑制剂。方法:采用Auto Dock Vina软件对蛋白质晶体结构数据库PDB中NA与小分子抑制剂扎那米韦形成的复合物(PDB代码为4MWX)三维结构活性部位进行分析,基于传统中药配体库进行分子对接初次筛选。综合运用传统中药系统药理学数据库及分析平台TCMSP及Accelrys公司开发的Discovery Studio 2.5分子模拟软件包内TOPKAT模块计算药代动力学参数和毒性预测对分子对接结果进行2次筛选。结果:以原配体(扎那米韦)的自由结合能为阈值,筛选出中国传统中药数据库中3个类药性良好的化学成分与NA亲和力高于上市的抗流感药物扎那米韦的天然小分子化合物,并且确定了它们的中草药来源。结论:该研究结果可促进从传统中药库中提取、设计及实验合成新抗H7N9流感病毒药物。

引用

页码：173 / 180

页数：8

共 11 条

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